Один их трёх храмов корейской Триратны ("три драгоценности": Будда, дхарма, сангха). Тхондоса посвящен непосредсвенно Будде (в то время как сангхе, монашеской общине, посвящен храм Сонгванса, а дхарме, учению Будды, посвящен Хэинса).
Храм был основан в 646 году мастером Чачжаном, побывавшим в Китае и принесшим оттуда такие реликвии, как одеяние Будды, чашу для подаяний, часть костей черепа Будды. Реликвии эти были разделены между тремя храмами, Тхондоса - единственный сохранившийся. В связи с тем, что "истинные мощи" Будды находятся в ступе на вершине "алмазной платформы", в главном здании храма, посвященном Будде Шакъямуни, нет статуи Будды - ибо зачем же создавать изображение того, кто в виде мощей находится непосредственно в храме?
Существует несколько версий происхождений названия храма. Тхон означает "проходить/быть подобным"; до - совершенствоваться, идти к нирване, следовать правилам буддийской жизни. Миряне, стремящиеся стать монахами, должны были "пройти сквозь/по алмазной платформе". Вторая версия: "обрести абсолютное знание, вести все существа к нирване" - миссия ветви буддизма Махаяна. Третья версия: гора, у подножия которой расположен храм, напоминает Гору орла (Гридхракута), где проповедовал Будда (и название у горы звучит так же по-корейски: Йонгчхуксан/Йончхисан - "Гора орла").
Храм сильно постродал в Имчжинскую войну 1592-1598 года, но был восстановлен к 1645 году. По количеству зданий и сооружений - более 50 - считается самым большим в Корее.
Включен во Всемирное наследие ЮНЕСКО в 2018 году.